一、牵头组织改善农村人居环境，组织开展农村厕所革命。

二、指导农用地、渔业水域以及农业生物物种资源的保护与管理有关工作。

三、负责水生野生动植物保护、耕地及永久基本农田质量保护工作。

四、指导农产品产地环境管理和农业清洁生产。

五、指导生态循环农业、节水农业以及农村可再生能源综合开发利用有关工作。

六、指导畜禽养殖场（户）畜禽粪污资源化利用。

七、承担农业外来物种管理有关工作。